西安航天神舟建筑設計院隸屬于中國航天科技集團公司第四研究院，成立于1984年10月，當時單位名稱為航天工業(yè)部第四研究院建筑設計室，1997年7月更名為中國航天工業(yè)總公司第四研究院建筑設計所，2001年12月更名為西安航天神舟建筑設計院。
    1992年我院取得中國航天工業(yè)總公司頒發(fā)的航天工程、建筑工程、市政工程丙級設計資質；1997年取得建設部頒發(fā)的軍工工程、建筑工程乙級設計資質；2000年取得國家發(fā)改委頒發(fā)的工程咨詢甲級資質；2002年取得陜西省建設廳頒發(fā)的城市規(guī)劃丙級設計資質；2003年質量體系通過陜西方圓認證中心ISO9001-2002認證審核；2005年通過軍工保密資格二級認證審核。2008年取得中華人民共和國建設部頒發(fā)的建筑行業(yè)建筑工程甲級和軍工行業(yè)（航天空間飛行器、導彈及火箭彈）甲級設計資質；2008年取得工程建設招標代理資質。2011年取得防雷工程乙級設計資質。
    2001年成立北京分院，到目前為止北京分院已相對獨立的開展設計、咨詢工作。